海底小纵队是一群活跃在海底的小小探险家，集结了巴克队长（北极熊）、皮医生（企鹅）、生物学家谢灵通（海獭）、摄像师达西西（腊肠狗）、机械工程师突突兔（兔子）、小队中尉呱唧（小猫）和章教授（章鱼）7名伙伴。在巴克队长的带领下，一直向着未知的海域不断探索前进！巴克队长和皮医生为了送小章鱼酷巴回家，结伴前往加勒比海。然而他们在途中遭遇了突发事件，必须穿过丛林，探索神秘的洞穴。在小纵队其他队员的支援下，他们展开了全新的探险之旅纵观全片，几乎每个人都形象饱满：巴克队长在几乎完美的形象下，表现出了一点“瑕疵”：害怕狭小空间。这让他增加了不少人情味儿。皮医生为了队长，克服心理障碍，勇敢地担起开路的重任。呱唧一如既往地用传说异闻为新生物新困难的出现铺垫。突突兔研究新舰艇。达西西因为一个懂洞穴潜水的朋友瑞拉而担任了组织搜救的任务。章教授的七只触手打乒乓球、第8只用来看书。小章鱼酷巴虽然台词少，除了引领目标（要回大海）外，还能在危急时刻喷墨汁，在淡水中分辨海水方向。就连植物鱼，都前有甜甜圈、后有芒果，用爱吃制造笑料，表达现象。唯有科学家谢灵通角色很弱，几乎回想不起哪句台词是谢灵通特色的。后来大猫回忆起了在芒果段落，谢灵通帮植物鱼做翻译，因为只有他听得懂植物鱼说话。往常的科学家哪儿去了呢？原来是因为引入了瑞拉。瑞拉到这里来是为了霹雳大毒牙，最后证明这是一种有毒的桨足虫，只有这里才有。瑞拉表示要放到新书里。这在过去，就是谢灵通的角色：研究一种新物种，记录到自己的笔记本里。这次为什么要换成瑞拉呢？因为地点是洞穴，需要洞穴潜水技能。瑞拉的身份是全世界最优秀的洞穴潜水者。谢灵通开个舰艇都费劲，而且海獭是海里的，不能适应这种淡水环